来过九寨沟的99.99%以上的游客，都不曾见过九寨沟深处，当地村民心中最为神圣的“扎依扎嘎圣山”。沟内扎依扎嘎神山为最高峰——山峰海拔4400米，山顶海拔4528米，据说这座神山是万山之主，是当地居民的圣地。
扎如寺坐落于扎如马道中途，一片占地颇大的苹果园中，是九寨沟附近最大、最有名气的喇嘛庙，也是苯教信仰者的一方圣地
宝镜崖，位于扎如沟沟口，高约400米，这块巨大的山崖临溪矗立，平整的表面如刀劈斧削一般，远远望去，像是一面硕大无朋的宝镜，相传这面宝镜是万山之主扎依扎嗄所立，下面镇压着一个残害百姓的魔鬼，因此也称魔鬼崖
九寨沟原始森林，占地2000多公顷，位于日则沟的尽头，在九寨沟的最南端。空气清新、尘埃少、噪声低、空气中氧和负氧离子含量高，是天然的大氧吧。
天鹅海位于日则沟，海拔2905米，与草海的下游相连。天鹅海是一个半沼泽湖泊，四周是茂密的山林和繁盛的花木，从原始森林下行经过这里。在广阔的湖上，野草茵茵，山花灿灿，一弯清流蜿蜒其间，时有天鹅起落，野鸭群游。
箭竹海海拔2618米，深6米，面积17万平方米，湖畔箭竹葱笼，杉木挺立，水中山峦对峙，竹影摇曳，此外，张艺谋的电影《英雄》也曾有残剑、无名在此比剑的场景，令其名声大噪。
熊猫海位于四川九寨沟，海拔2587米，深14米，面积9万平方米。这儿常有熊猫活动。在阳光的照耀下，熊猫海的波纹反射出绚目的色彩，给人一种迷离的感觉
熊猫海瀑布高度达80米，以高峻著称，在九寨沟瀑布中是落差最大的一个
九寨沟五花海海拔2472米，水深5米，面积9万平方米，被誉为“九寨沟一绝”和“九寨精华”，在珍珠滩瀑布之上，熊猫湖的下部于日则沟孔雀河上游的尽头
孔雀河道是从五花海出水口的栈桥登上环山公路，沿着公路下坡，左侧深谷里的一条河道。漫步其中，就像是走在一副最浓烈的色彩创造出来的油画里，周围的风光犹如孔雀羽一样，将尘世间最美丽的蓝和绿都融合在一起。
